1.化學處理方法
在抗生素制藥廢水的化學處理方法中，采用臭氧氧化的方法能提高抗生素廢水的BOD5/COD 比值，同時對COD有較好的去除率。
2.物化處理方法
由于抗生素生產廢水成分復雜、有機物含量高、含有少量的殘留抗生素，在采用生化處理時，殘留抗生素對微生物的強烈阻止作用可造成污水處理過程復雜、成本高和效果不穩定。因此在抗生素廢水的處理過程中，直接采用物化處理方法或作為后續生化處理的預處理方法以降。
3.厭氧處理方法
由于厭氧處理過程中起主要代謝作用的產酸菌和產甲烷菌具有相對不同的生物學特征，因此可以分別構造適合其生長的不同環境條件，利用產酸菌生長快、對毒物敏感性差的特點將其作為厭氧過程的首段，以提高廢水的可生化性，減少廢水的復雜成分及毒性對產甲烷菌的阻止作用，提高處理系統的抗沖擊負荷能力，進而保證后續復合厭氧處理系統的產甲烷階段處理效果的穩定性。
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